Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP56O00567 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP56O00567 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP56O00567 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP56O00567 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOP56O00567 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOP56O00567 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP56O00567 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP56O00567 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP56O00567 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP56O00567 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP56O00567 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP56O00567 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP56O00567 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP56O00567 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP56O00567 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP56O00567 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP56O00567 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP56O00567 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP56O00567 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP56O00567 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP56O00567 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP56O00567 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP56O00567 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP56O00567 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP56O00567 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP56O00567 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP56O00567 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP56O00567 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NOP56O00567 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP56O00567 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP56O00567 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP56O00567 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP56O00567 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NOP56O00567 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NOP56O00567 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP56O00567 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NOP56O00567 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP56O00567 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP56O00567 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP56O00567 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP56O00567 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP56O00567 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP56O00567 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP56O00567 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP56O00567 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP56O00567 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP56O00567 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP56O00567 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP56O00567 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP56O00567 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP56O00567 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP56O00567 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP56O00567 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP56O00567 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP56O00567 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP56O00567 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP56O00567 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP56O00567 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP56O00567 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP56O00567 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP56O00567 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP56O00567 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP56O00567 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP56O00567 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP56O00567 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP56O00567 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP56O00567 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP56O00567 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP56O00567 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP56O00567 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP56O00567 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP56O00567 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP56O00567 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP56O00567 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP56O00567 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP56O00567 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP56O00567 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP56O00567 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP56O00567 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP56O00567 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP56O00567 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP56O00567 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP56O00567 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms