Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA2O00451 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA2O00451 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GFRA2O00451 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA2O00451 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GFRA2O00451 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms