Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QRE1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRE1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRE1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRE1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRE1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QRE1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRE1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRE1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QRE1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRE1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRE1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRE1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRE1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRE1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRE1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QRE1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QRE1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QRE1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QRE1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QRE1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QRE1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QRE1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QRE1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QRE1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QRE1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRE1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRE1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRE1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRE1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRE1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRE1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QRE1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QRE1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRE1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRE1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRE1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRE1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRE1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QRE1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QRE1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QRE1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QRE1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QRE1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QRE1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QRE1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QRE1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRE1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRE1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QRE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRE1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRE1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRE1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRE1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QRE1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QRE1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QRE1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QRE1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QRE1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRE1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRE1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRE1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QRE1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRE1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRE1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRE1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRE1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRE1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QRE1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRE1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRE1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRE1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRE1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRE1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QRE1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QRE1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QRE1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QRE1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QRE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QRE1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QRE1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QRE1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRE1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRE1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRE1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRE1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QRE1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRE1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRE1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRE1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QRE1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRE1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QRE1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1404 ms