Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN34H7C241 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN34H7C241 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN34H7C241 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms