Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK3BL1B0FP48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK3BL1B0FP48 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK3BL1B0FP48 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK3BL1B0FP48 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms