Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SSPOA2VEC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SSPOA2VEC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSPOA2VEC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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