Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLRN2A0PK11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CLRN2A0PK11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLRN2A0PK11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLRN2A0PK11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CLRN2A0PK11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
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