Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPI6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPI6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A096LPI6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A096LPI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A096LPI6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A096LPI6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms