Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.957e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 CALCOCO2-221ENST00000513119 973 ntTSL 59.08□□□□□ -0.967e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.997e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 G3BP2-210ENST00000507745 584 ntTSL 48.78□□□□□ -17e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 DNAJC7-207ENST00000586335 579 ntTSL 38.74□□□□□ -1.017e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 G3BP2-214ENST00000509561 559 ntTSL 48.28□□□□□ -1.087e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 DNAJC7-210ENST00000588641 782 ntTSL 38.13□□□□□ -1.117e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 CALCOCO2-224ENST00000514962 765 ntTSL 27.25□□□□□ -1.257e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.257e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.287e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 CALCOCO2-207ENST00000505071 495 ntTSL 56.3□□□□□ -1.47e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 G3BP2-213ENST00000509100 514 ntTSL 55.39□□□□□ -1.557e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 DNAJC7-220ENST00000590847 441 ntTSL 24.31□□□□□ -1.727e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 PSMD14-205ENST00000492908 1786 ntTSL 24.04□□□□□ -1.767e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 ELP2-219ENST00000542050 690 ntTSL 33.27□□□□□ -1.897e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 PSMD14-203ENST00000477232 4890 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.977e-6■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 HMGCS1-206ENST00000511774 500 ntTSL 423.3■■□□□ 1.321e-7■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 MARS-207ENST00000547062 571 ntTSL 225.52■■□□□ 1.681e-7■□□□□ 8.9
G3BP1Q13283 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 422.5■■□□□ 1.194e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.074e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.014e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-218ENST00000600358 1267 ntTSL 520.19■□□□□ 0.824e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-210ENST00000594847 814 ntTSL 318.78■□□□□ 0.64e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-224ENST00000602397 631 ntTSL 318.78■□□□□ 0.64e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-203ENST00000435164 1551 ntTSL 217.59■□□□□ 0.414e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 STRN4-209ENST00000594704 913 ntTSL 517.54■□□□□ 0.44e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ECH1-203ENST00000594391 919 ntTSL 520.89■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 PSMC5-215ENST00000583283 602 ntTSL 424.7■■□□□ 1.543e-7■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 CNP-207ENST00000587679 581 ntTSL 429.12■■■□□ 2.253e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-202ENST00000415758 1287 ntTSL 518.94■□□□□ 0.625e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-208ENST00000467318 1665 ntTSL 518.27■□□□□ 0.525e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-205ENST00000433257 1682 ntTSL 517.42■□□□□ 0.385e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EIF3G-214ENST00000593066 590 ntTSL 515.46■□□□□ 0.075e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-209ENST00000473924 385 ntTSL 515.4■□□□□ 0.065e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-206ENST00000446987 1853 ntTSL 515.2■□□□□ 0.025e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EIF3G-205ENST00000587993 555 ntTSL 313.56□□□□□ -0.245e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-203ENST00000421223 3028 ntTSL 213.33□□□□□ -0.285e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EIF3G-215ENST00000593095 636 ntTSL 313.08□□□□□ -0.325e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 DDX56-212ENST00000485367 1781 ntTSL 513.07□□□□□ -0.325e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EIF3G-211ENST00000590940 762 ntTSL 312.86□□□□□ -0.355e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.495e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EIF3G-204ENST00000587681 537 ntTSL 29.46□□□□□ -0.95e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 CNOT11-203ENST00000462489 572 ntTSL 22.7□□□□□ -1.982e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.662e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EFNA1-203ENST00000469878 1288 ntTSL 316.68■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.044e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 214.33□□□□□ -0.124e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 213.12□□□□□ -0.314e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.384e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 512.44□□□□□ -0.424e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.434e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.554e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.634e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 510.47□□□□□ -0.734e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.84e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 55.23□□□□□ -1.574e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.754e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 KANK1-202ENST00000382286 2266 ntTSL 215.19■□□□□ 0.022e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 LASP1-207ENST00000581485 617 ntTSL 319.61■□□□□ 0.733e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 319.45■□□□□ 0.73e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ACTN4-205ENST00000477174 544 ntTSL 316.66■□□□□ 0.261e-12■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 POR-224ENST00000496888 939 ntTSL 220.96■□□□□ 0.951e-10■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.323e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.043e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 LRP1-211ENST00000556356 5114 ntTSL 218.93■□□□□ 0.623e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.2■□□□□ 0.343e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.253e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 SREBF2-206ENST00000464119 432 ntTSL 214.56□□□□□ -0.083e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.673e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 SREBF2-204ENST00000462539 796 ntTSL 28.81□□□□□ -13e-9■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 NMT1-210ENST00000590310 704 ntTSL 222.47■■□□□ 1.191e-7■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ST13-204ENST00000455824 798 ntTSL 520.28■□□□□ 0.848e-11■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ST13-205ENST00000480048 592 ntTSL 415.42■□□□□ 0.068e-11■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 27.95□□□□□ -1.145e-30■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 HNRNPK-203ENST00000376256 562 ntTSL 26.62□□□□□ -1.352e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 EFTUD2-209ENST00000587957 503 ntTSL 313.2□□□□□ -0.31e-13■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 TOX4-201ENST00000416256 724 ntTSL 521.55■■□□□ 1.048e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 TOX4-202ENST00000447695 633 ntTSL 421.01■□□□□ 0.958e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 TOX4-204ENST00000455138 549 ntTSL 420.73■□□□□ 0.918e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 TOX4-210ENST00000494242 650 ntTSL 319.16■□□□□ 0.668e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 TOX4-206ENST00000457430 565 ntTSL 417.23■□□□□ 0.358e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 ELP1-202ENST00000467959 437 ntTSL 310.29□□□□□ -0.768e-8■□□□□ 8.8
G3BP1Q13283 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.012e-85■□□□□ 8.8
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 546.5 ms