RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.65■■■□□ 2.02
EFTUD2-209ENST00000587957 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.15■■□□□ 1.78
EFTUD2-209ENST00000587957 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.37■■□□□ 1.33
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXD1Q16676 465 aa23.2■■□□□ 1.3
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCC9O60706 1549 aa23.17■■□□□ 1.3
EFTUD2-209ENST00000587957 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.12■■□□□ 1.13
EFTUD2-209ENST00000587957 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.1■■□□□ 1.13
EFTUD2-209ENST00000587957 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.03■■□□□ 1.12
EFTUD2-209ENST00000587957 NACADO15069 1562 aa22■■□□□ 1.11
EFTUD2-209ENST00000587957 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.72■■□□□ 1.07
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.7■■□□□ 1.07
EFTUD2-209ENST00000587957 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.66■■□□□ 1.06
EFTUD2-209ENST00000587957 MSH5O43196 834 aa21.61■■□□□ 1.05
EFTUD2-209ENST00000587957 ADRA2BP18089 450 aa21.6■■□□□ 1.05
EFTUD2-209ENST00000587957 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
EFTUD2-209ENST00000587957 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
EFTUD2-209ENST00000587957 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.55■■□□□ 1.04
EFTUD2-209ENST00000587957 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.43■■□□□ 1.02
EFTUD2-209ENST00000587957 SCRIBQ14160 1630 aa21.42■■□□□ 1.02
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.37■■□□□ 1.01
EFTUD2-209ENST00000587957 POTEDQ86YR6 584 aa21.22■□□□□ 0.99
EFTUD2-209ENST00000587957 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.13■□□□□ 0.97
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
EFTUD2-209ENST00000587957 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.91■□□□□ 0.94
EFTUD2-209ENST00000587957 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.81■□□□□ 0.92
EFTUD2-209ENST00000587957 SMARCA4P51532 1647 aa20.38■□□□□ 0.85
EFTUD2-209ENST00000587957 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
EFTUD2-209ENST00000587957 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-209ENST00000587957 SMARCA2P51531 1590 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-209ENST00000587957 NCAPD3P42695 1498 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-209ENST00000587957 HMGXB3Q12766 1538 aa20.19■□□□□ 0.82
EFTUD2-209ENST00000587957 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.19■□□□□ 0.82
EFTUD2-209ENST00000587957 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
EFTUD2-209ENST00000587957 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.1■□□□□ 0.81
EFTUD2-209ENST00000587957 ERCC6Q03468 1493 aa20.02■□□□□ 0.8
EFTUD2-209ENST00000587957 WIZO95785 1651 aa20■□□□□ 0.79
EFTUD2-209ENST00000587957 NESP48681 1621 aa19.96■□□□□ 0.79
EFTUD2-209ENST00000587957 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
EFTUD2-209ENST00000587957 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
EFTUD2-209ENST00000587957 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.83■□□□□ 0.76
EFTUD2-209ENST00000587957 CUX2O14529 1486 aa19.78■□□□□ 0.76
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.75■□□□□ 0.75
EFTUD2-209ENST00000587957 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
EFTUD2-209ENST00000587957 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.7■□□□□ 0.74
EFTUD2-209ENST00000587957 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.7■□□□□ 0.74
EFTUD2-209ENST00000587957 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.7■□□□□ 0.74
EFTUD2-209ENST00000587957 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
EFTUD2-209ENST00000587957 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
EFTUD2-209ENST00000587957 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.54■□□□□ 0.72
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.54■□□□□ 0.72
EFTUD2-209ENST00000587957 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.53■□□□□ 0.72
EFTUD2-209ENST00000587957 CFTRP13569 1480 aa19.52■□□□□ 0.72
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.48■□□□□ 0.71
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR62O43379 1518 aa19.46■□□□□ 0.71
EFTUD2-209ENST00000587957 PRDM2Q13029 1718 aa19.45■□□□□ 0.7
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.39■□□□□ 0.69
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.34■□□□□ 0.69
EFTUD2-209ENST00000587957 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
EFTUD2-209ENST00000587957 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
EFTUD2-209ENST00000587957 TOPBP1Q92547 1522 aa19.18■□□□□ 0.66
EFTUD2-209ENST00000587957 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.15■□□□□ 0.66
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCC8Q09428 1581 aa19.11■□□□□ 0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 IFT140Q96RY7 1462 aa19.09■□□□□ 0.65
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CUX1P39880 1505 aa18.96■□□□□ 0.63
EFTUD2-209ENST00000587957 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.95■□□□□ 0.62
EFTUD2-209ENST00000587957 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.95■□□□□ 0.62
EFTUD2-209ENST00000587957 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.95■□□□□ 0.62
EFTUD2-209ENST00000587957 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 12.3
EFTUD2-209ENST00000587957 OSCARQ8IYS5 282 aa18.92■□□□□ 0.62
EFTUD2-209ENST00000587957 SOGA1O94964 1423 aa18.91■□□□□ 0.62
EFTUD2-209ENST00000587957 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM41Q8WV44 630 aa18.85■□□□□ 0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 CHD1O14646 1710 aa18.84■□□□□ 0.61
EFTUD2-209ENST00000587957 FBLN2P98095 1184 aa18.83■□□□□ 0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR97A6NE52 1622 aa18.79■□□□□ 0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.79■□□□□ 0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.78■□□□□ 0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 SYNJ1O43426 1573 aa18.75■□□□□ 0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 PBRM1Q86U86 1689 aa18.74■□□□□ 0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.73■□□□□ 0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GRIN2BQ13224 1484 aa18.72■□□□□ 0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 TOP2BQ02880 1626 aa18.72■□□□□ 0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.71■□□□□ 0.59
EFTUD2-209ENST00000587957 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.71■□□□□ 0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.71■□□□□ 0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.71■□□□□ 0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.7■□□□□ 0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.7 ms