Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO3Q9Y5L0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO3Q9Y5L0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNPO3Q9Y5L0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNPO3Q9Y5L0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO3Q9Y5L0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms