Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAN1Q9Y2M0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FAN1Q9Y2M0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAN1Q9Y2M0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAN1Q9Y2M0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms