Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AGTPBP1Q9UPW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AGTPBP1Q9UPW5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
AGTPBP1Q9UPW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms