Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IQSEC3Q9UPP2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IQSEC3Q9UPP2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IQSEC3Q9UPP2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
IQSEC3Q9UPP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IQSEC3Q9UPP2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IQSEC3Q9UPP2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IQSEC3Q9UPP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IQSEC3Q9UPP2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IQSEC3Q9UPP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IQSEC3Q9UPP2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IQSEC3Q9UPP2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
IQSEC3Q9UPP2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IQSEC3Q9UPP2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms