Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN11Q9UMQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN11Q9UMQ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN11Q9UMQ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN11Q9UMQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms