Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC3Q9UHC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ASIC3Q9UHC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms