Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM8A1Q9UBU6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM8A1Q9UBU6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM8A1Q9UBU6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM8A1Q9UBU6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM8A1Q9UBU6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms