Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBA2Q9UBT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA2Q9UBT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA2Q9UBT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBA2Q9UBT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA2Q9UBT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms