Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG2Q9UBF2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG2Q9UBF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG2Q9UBF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG2Q9UBF2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG2Q9UBF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPG2Q9UBF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPG2Q9UBF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPG2Q9UBF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPG2Q9UBF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPG2Q9UBF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms