Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTEL1Q9NZ71 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RTEL1Q9NZ71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTEL1Q9NZ71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTEL1Q9NZ71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1Q9NZ71 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms