Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKIRAS2Q9NYR9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKIRAS2Q9NYR9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKIRAS2Q9NYR9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms