Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VNN3Q9NY84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VNN3Q9NY84 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VNN3Q9NY84 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VNN3Q9NY84 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VNN3Q9NY84 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms