Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SLC52A1Q9NWF4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLC52A1Q9NWF4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLC52A1Q9NWF4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SLC52A1Q9NWF4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SLC52A1Q9NWF4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms