Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM106BQ9NUM4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM106BQ9NUM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM106BQ9NUM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM106BQ9NUM4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms