Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF1Q9NS23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF1Q9NS23 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF1Q9NS23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASSF1Q9NS23 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms