Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG9

AAAS, Aladin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAASQ9NRG9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AAASQ9NRG9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AAASQ9NRG9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AAASQ9NRG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
AAASQ9NRG9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms