Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO8Q9NRD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO8Q9NRD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO8Q9NRD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms