Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCFQ9NPI8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCFQ9NPI8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCFQ9NPI8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FANCFQ9NPI8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms