Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GFRA4Q9GZZ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA4Q9GZZ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA4Q9GZZ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms