Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCLK3Q9C098 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
DCLK3Q9C098 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCLK3Q9C098 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCLK3Q9C098 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms