Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM2Q9C040 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM2Q9C040 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM2Q9C040 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM2Q9C040 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms