Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBCK1Q9BYM8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBCK1Q9BYM8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBCK1Q9BYM8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBCK1Q9BYM8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms