Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL13Q9BYD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL13Q9BYD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL13Q9BYD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL13Q9BYD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL13Q9BYD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL13Q9BYD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL13Q9BYD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL13Q9BYD1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms