Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
SYCP2Q9BX26 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
SYCP2Q9BX26 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SYCP2Q9BX26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SYCP2Q9BX26 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SYCP2Q9BX26 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
SYCP2Q9BX26 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SYCP2Q9BX26 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYCP2Q9BX26 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms