Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC2P3Q9BVR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC2P3Q9BVR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC2P3Q9BVR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC2P3Q9BVR0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms