Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KATNB1Q9BVA0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KATNB1Q9BVA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KATNB1Q9BVA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNB1Q9BVA0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.5 ms