Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM4BQ9BQ04 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM4BQ9BQ04 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM4BQ9BQ04 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms