Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP4Q96P64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP4Q96P64 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP4Q96P64 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms