Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
LRRIQ1Q96JM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.62■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
LRRIQ1Q96JM4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
LRRIQ1Q96JM4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
LRRIQ1Q96JM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
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