Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10Q96HG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10Q96HG1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM10Q96HG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM10Q96HG1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMIM10Q96HG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMIM10Q96HG1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM10Q96HG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms