Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNF8Q96H20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNF8Q96H20 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNF8Q96H20 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNF8Q96H20 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms