Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC3Q92966 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC3Q92966 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAPC3Q92966 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms