Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1CQ92928 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB1CQ92928 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB1CQ92928 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB1CQ92928 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB1CQ92928 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB1CQ92928 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB1CQ92928 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB1CQ92928 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB1CQ92928 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms