Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSPC1Q8WXF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSPC1Q8WXF1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSPC1Q8WXF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSPC1Q8WXF1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms