Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNRF4Q8WWF5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF4Q8WWF5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF4Q8WWF5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms