Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf54Q8WWF1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf54Q8WWF1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf54Q8WWF1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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