Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBASH3BQ8TF42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3BQ8TF42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3BQ8TF42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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