Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CADM4Q8NFZ8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CADM4Q8NFZ8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CADM4Q8NFZ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CADM4Q8NFZ8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CADM4Q8NFZ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CADM4Q8NFZ8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CADM4Q8NFZ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms