Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC112Q8NEF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC112Q8NEF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms