Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA1Q8N8W4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNPLA1Q8N8W4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNPLA1Q8N8W4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA1Q8N8W4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms